孙策死的时候，虞翻不在身边，他正留守会稽。原来，孙策拿下豫章全定江东后，就对虞翻说：“孤有征讨事，未得还府，卿复以功曹为吾萧何，守会稽耳。”这样虞翻就乖乖回到了会稽，替不能到任的会稽太守孙策全权处理会稽郡事务，这段期间，虞翻就像萧何那样，镇后方，抚百姓，给饷馈，统筹调度，为前方征战的孙策提供后勤保障，干的是兢兢业业、有声有色，却没想到他与孙策这一别竟成永诀。
噩耗传来，会稽府内一片悲声，各县长官都想前往奔丧，虞翻却平静的说道：“恐邻县山民或有奸变，远委城郭，必致不虞。”乃一面服丧一面照常处理公务，诸县效之，内外皆安。孙策的堂兄孙暠本想浑水摸鱼夺取会稽，见无机可趁，只得作罢。
我们无从知晓虞翻为何能如此平静，平静得近乎于无情，我只知道，孙策死后，那个才华横溢、雄心壮志的虞仲翔从此消失了，再次出现在史书中的那个人，被网友戏称为东吴第一大喷子，与祢衡齐名。
我只能猜测，或许，虞翻对于没有劝动孙策太过悔恨吧，又或许，他经历孙策之死后大受打击……总之，虞翻从此性情大变，孙权本来挺想重用他的，还让他担任骑都尉，与程普张纮太史慈同级别，但他“数犯颜谏争”，惹得孙权很不高兴，于是随便找了个借口将他发配到了泾县这个山越蛮荒之地，一发就是十几年，虞翻空有满腔才华抱负却无处施展，他于是在那个蛮荒之处变得越发执拗，就像块又臭又硬的茅坑石头，每天跟这个喷那个喷，招来众人毁谤，只有张纮颇为理解他，表示：“虞仲翔前颇为论者所侵，美宝为质，雕摩益光，不足以损”。
就这样，直到建安二十四年（219年），吕蒙称病回到建业与孙权商量图谋关羽之事，趁机以虞翻精通医理、为自己治病为由，将他解救出来。虞翻由此成为了吕蒙军中的谋主。此后吕蒙白衣渡江，袭夺荆州，关键时刻，又是虞翻跑到公安城下，写一封信进城内，公安守将傅士仁就哭着投降了，然后吕蒙又带着傅士仁华丽丽的说降了江陵守将糜芳，兵不血刃拿下整个南郡，断了关羽的后路。
然而，糜芳开城出降后，吕蒙被胜利冲昏了头脑，竟然在城边沙滩上开起了庆功会，这时又是虞翻跑出来一语点醒梦中人：“今区区一心者糜将军也，城中之人岂可尽信，何不急入城持其管籥乎？“一个糜芳出来投降你就得意忘形啦，城中要有人造反了咋办？何不进城之后再开party呢？
吕蒙大惊，多谢先生提醒，赶紧入城掌控城中要地，结果城中果然有人准备埋伏，再晚一日，吴军必将栽个大跟头。
而关羽失去了老窝南郡，很快就败走麦城，孙权听闻很焦虑，一个劲的问左右：前方战报来了没，关羽死了没有？虞翻在旁看着好笑，说主公你别激动，我帮你算一卦吧！孙权知道虞翻是易学宗师，大喜，赶紧让他算，虞翻卜得一卦后说：“不出二日，必当断头。”果如其言，刚好二日。
孙权这才发现，这虞翻还有点用啊，乃大笑：“卿不及伏羲，可与东方朔为比矣。“
虞翻不说话，心中长叹，孙讨虏以东方朔比我，以我为弄臣耶，可悲可叹！
而就在这个时候，荆州之战的大功臣吕蒙突然病情急转直下，虽经虞翻及东吴多位名医精心诊治，但终究药石无灵，英年早逝，死时年仅四十二岁。